Il miglior tempo nelle prove ufficiali di MotoGP del GP del Giappone è stato realizzato dal redivivo Marc Marquez.
L'otto volte campione del mondo sulla pista bagnata ha preceduto Johann Zarco e Brad Binder.
Nella giornata caratterizzata dalla lunga interruzione causata dal tifone abbattutosi su Motegi durante le Moto2, il numero 93, alla sua seconda gara dopo l'ennesimo rientro alle gare, è tornato in pole position a tre anni di distanza dall'ultima volta. Nelle altre categorie davanti a tutti scatteranno Aron Canet in Moto2 e Tatsuki Suzuki in Moto3.