Face aux mutants La Suisse réagit grâce à la génomique

Keystone-SDA, ch, ats

28.05.2021, 15:10

ATS

L’Office fédéral de la santé publique (OFSP) a entériné la mise en place d’un programme national de surveillance génomique du SARS-CoV-2. La surveillance des variants et le suivi de la prévalence de la maladie au sein de la population sont deux éléments importants dans la lutte contre le nouveau coronavirus.

Cette surveillance permet de suivre l'évolution des différents variants et d'évaluer le risque d'apparition de souches échappant à l'immunité engendrée par les différents vaccins ou par une infection préalable, explique l'OFSP vendredi.

Si la plupart des mutations n'ont pas d'impact épidémiologique ou clinique, certaines augmentent la contagiosité ou la pathogénicité du virus, ou réduisent sa sensibilité à l'immunité induite par les vaccins ou une infection préalable.

Le séquençage génomique du virus permet une classification fine des mutants émergeant au cours du temps, permettant de retracer des chaînes de transmission et si nécessaire d'adapter les mesures.

2000 échantillons par semaine

Près de 2000 échantillons positifs au SARS-CoV-2 sont analysés chaque semaine, un nombre appelé à évoluer en fonction de la situation épidémiologique. L'objectif est d'identifier rapidement les variantes préoccupantes du virus, leur possible importation par des voyageurs et leur répartition à travers le pays.

Le programme, qui prévoit aussi une surveillance des eaux usées, s'étend du 1er mars 2021 au 31 mars 2022. Il est financé par l'OFSP pour un an à hauteur de 10 millions de francs, a précisé celui-ci à Keystone-ATS. Il est coordonné par le Centre pour les virus émergents aux Hôpitaux universitaires de Genève (HUG) et le laboratoire de référence (CRIVE).

Les Ecoles polytechniques fédérales, les laboratoires universitaires et privés, la plateforme NextStrain et la Task Force scientifique Covid-19 collaborent au programme. La stratégie repose sur les recommandations de l'Organisation mondiale de la santé.