YB commencera la phase de ligue nouvellement créée de la Ligue des champions le mardi 17 septembre par un match à domicile contre Aston Villa. Deux semaines plus tard, l'équipe de l'entraîneur Patrick Rahmen affrontera Barcelone chez lui.
Les Bernois recevront l'Inter de Yann Sommer le 23 octobre. Lors du huitième et dernier match de cette phase, l'Etoile Rouge Belgrade se présentera le 29 janvier 2025.
Les huit premières des 36 équipes se qualifient directement pour les huitièmes de finale après avoir joué quatre matches à domicile et quatre à l'extérieur. Les équipes classées de la 9e à la 24e place disputent un tour de barrage. Le mode de la phase à élimination directe, avec des matches aller-retour, reste inchangé.